Seine Ausbildung zum A-Kirchenmusiker erhielt Thomas Meyer-Bauer an der Hochschule für Kirchenmusik in Herford. Schon bald wurde er als Dozent für Generalbass und Partiturspiel an seine ehemalige Ausbildungsstätte berufen. Berufsbegleitend absolvierte er ein Orgelstudium am renommierten Sweelinkkonservatorium in Amsterdam. Nach langjähriger Tätigkeit in Gütersloh-Isselhorst lebt er seit 2002 mit seiner Familie als Kantor der Ev.-luth. Kirchengemeinde in Varel. Er ist zudem Kreiskantor des Kirchenmusikbereiches Varel und Orgelsachverständiger der Ev.-Luth. Kirche in Oldenburg.